Najczęściej zadawane pytania dotyczące koronawirusa: Pomóż mi ze słownictwem omikronowym. Co to jest unikanie odporności? Epistaza?

Co tydzień odpowiadamy na najczęściej zadawane pytania dotyczące życia w czasie kryzysu związanego z koronawirusem. Jeśli masz pytanie, które chciałbyś, abyśmy rozważyli w przyszłym poście, napisz do nas na [email protected] z tematem: „Cotygodniowe pytania dotyczące koronawirusa”. Zobacz archiwum naszych najczęściej zadawanych pytań tutaj.

Kiedy czytam o nowym wariancie omicron, czuję, że muszę zrobić dyplom z medycyny. Co dokładnie oznacza „unikanie odporności”? Test neutralizacji wirusa?! Pomoc!

Rozumiemy: wiadomości o COVID-19 przychodzą szybko, a ci z nas bez dyplomu medycznego mogą czuć się trochę zagubieni. Zwróciliśmy się więc do trzech doświadczonych ekspertów od COVID – Dr Jill Weatherhead, adiunkt chorób zakaźnych dorosłych i dzieci w Baylor College of Medicine; dr Greg Polska, profesor medycyny i chorób zakaźnych w Mayo Clinic w Rochester, Min.; oraz dr Matthew Binnicker, wiceprezes ds. praktyki, Wydział Medycyny Laboratoryjnej i Patologii w Klinice Mayo – aby pomóc nam przetłumaczyć niektóre terminy, z którymi możesz się spotkać.

Zacznijmy więc od cytatu z Weatherhead:

„Wariant omikronowy ma ponad 50 mutacji genetycznych w genomie wirusa. Wiele z tych mutacji znajduje się w regionie białka kolczastego” – mówi Weatherhead. „Niektóre z poszczególnych mutacji sugerują, że wariant omikronu może być bardziej zakaźny lub unikać odpowiedzi immunologicznych. Pomimo powiązania tych mutacji z zakaźnością i unikaniem odporności, kliniczny wpływ omikronu pozostaje nieznany ze względu na zjawisko epistazy”.

Jeśli nie rozumiesz tego wszystkiego, oto przewodnik, który pomoże.

Mutacja: Mutacja to zmiana w kodzie genetycznym wirusa. Mutacje są normalną częścią replikacji wirusa. Wirusy tworzą kopie samych siebie, rozprzestrzeniając się w człowieku. Mutacje powstają, gdy podczas kopiowania popełni się błąd. W rzadkich przypadkach mutacje zmieniają zachowanie wirusa. Przez większość czasu nie.

Wariant: Zasadniczo wariant jest wersją wirusa o nieco innej sekwencji genetycznej z powodu pojawienia się mutacji. Wiele mutacji szybko znika wraz z rozprzestrzenianiem się wirusa. Ale czasami mutacje pozostają i są przekazywane przyszłym pokoleniom wirusa. Z biegiem czasu wirus może gromadzić unikalny zestaw mutacji, który odróżnia go od innych wersji wirusa. Te różne wersje nazywane są wariantami.

Wariant obawy (LZO): Światowa Organizacja Zdrowia oraz Centra Kontroli i Zapobiegania Chorobom monitorują warianty i ostrzegają opinię publiczną o wariantach budzących obawy, które mogą stwarzać dodatkowe ryzyko ze względu na „zwiększoną przenośność, nasilenie choroby lub zmniejszoną skuteczność interwencji w zakresie zdrowia publicznego [diagnostic tests, preventive measures like vaccines or therapeutic measures like monoclonal antibodies]”, wyjaśnia Weatherhead.

Możliwość przenoszenia: Zdolność wirusa do rozprzestrzeniania się z zainfekowanych ludzi na inne osoby. Wariant delta jest bardziej przenośny niż wcześniejsze warianty ze względu na mutacje w jego białku wypustkowym, które sprawiają, że lepiej wiąże się z komórkami i infekuje je. Istnieje obawa, że ​​omicron może być jeszcze bardziej przepuszczalny niż wysoce przepuszczalny wariant delta, ale nie wiemy jeszcze, czy tak jest.

Unikanie odporności: Po infekcji lub szczepionce twoje ciało wytwarza przeciwciała, które mogą wykryć i zabić wirusa przy kolejnej ekspozycji. Czasami wirus może zmutować w sposób, który pomaga mu uniknąć wykrycia przez te przeciwciała. To właśnie naukowcy nazywają „unikaniem odporności”. Jest wstępne dowody że omicron może być znacznie lepszy w unikaniu odporności niż wariant delta lub jakikolwiek wcześniejszy wariant ze względu na specyficzne mutacje w swoim białku szczytowym.

Pokonanie konkurencji: W sporcie, jeśli pokonasz innych sportowców, dobiegając do mety jako pierwszy lub zdobywając najwięcej punktów, jesteś numerem 1. W świecie wirusów wygrywanie jest bardziej jak reality show Niedobitek; Wirusy mogą ewoluować, aby zarażać więcej ludzi — lub zarażać ich szybciej — niż poprzednie warianty i stać się numerem 1. „To w zasadzie przetrwanie najsilniejszych” — wyjaśnia Binnicker. „Delta pokazała nam, że jest królem wzgórza. W ciągu najbliższych dwóch do czterech tygodni będziemy musieli zobaczyć, czy omicron jest lepszy w transmisji niż delta”. Jeśli tak, prawdopodobnie wypchnie deltę z wielu regionów świata i może stać się wariantem dominującym.

Epistaza: Greckie korzenie tego słowa oznaczają „nadeptać”. Więc co to ma wspólnego z wirusami? Cóż, w genetyce termin ten opisuje, w jaki sposób mutacje są od siebie zależne. To, w jaki sposób pojedyncza mutacja powoduje zachowanie wirusa, często zależy od innych obecnych mutacji. Dlatego naukowcy nie mogą przyjrzeć się pojedynczej mutacji i dokładnie wiedzieć, jak zmieni ona wirusa — mutacje należy oceniać razem. Pomyśl o tym jak o cheerleaderce stojącej jedna na drugiej: każdy ruch jednego z nich zwykle wpływa na całą formację.

Test neutralizacji wirusa (VNA): OK, rozbierzmy to na części. Esej to test. Neutralizacja to termin dobrze znany miłośnikom science fiction. Jeśli zneutralizujesz atak obcego statku, wygrywasz! W świecie wirusów chcemy wiedzieć, czy przeciwciała mogą zatrzymać lub zneutralizować cząsteczkę wirusa. A sposobem, aby się tego dowiedzieć, jest VNA: test laboratoryjny, który mierzy zdolność i wielkość ludzkich przeciwciał do powstrzymania infekcji. Ten test można wykorzystać do określenia, jak dobrze działa część układu odpornościowego, aby zapobiec lub usunąć infekcję. Naukowcy mogą go wykorzystać do oszacowania skuteczności szczepionki.

Odporność hybrydowa: Naukowcy twierdzą, że osoba ma „odporność hybrydową”, jeśli została zarażona SARS-CoV-2, a następnie, co najmniej sześć miesięcy później, otrzymała szczepionkę COVID-19. Ten scenariusz wyzwala wysoki poziom przeciwciał i silną ochronę przed wariantami. Niektórzy naukowcy nazywają to „superodpornością”.

Białko szczytowe: Prawdopodobnie widziałeś więcej niż wystarczająco zdjęć wirusa SARS-CoV-2. Białko kolce tworzy guzki na cząsteczce wirusa. Jest to krytyczny region wirusa z kilku powodów. Białka kolczaste wiążą się z ludzkimi komórkami i pomagają wirusowi wniknąć do komórek. A te szczytowe białka są celem wielu niezbędnych przeciwciał. Głównym sposobem, w jaki układ odpornościowy wykrywa wirusa, są białka szczytowe.

Środki zapobiegawcze: OK, to nie jest trudne. A na razie faktem jest, że nie wiadomo wystarczająco dużo, aby podjąć kroki w celu zapobiegania infekcjom poza szczepieniami i stymulacją oraz przestrzeganie strategii zapobiegania zaślepieniu i fizycznemu dystansowaniu się, które stosowaliśmy podczas pandemii koronawirusa.

Sheila Mulrooney Eldred jest niezależną dziennikarką zajmującą się zdrowiem w Minneapolis. O COVID-19 pisała w wielu publikacjach, m.in New York Times, Kaiser Health News, Medscape i Washington Post. Więcej w sheilaeldred.pressfolios.com. Na Twitterze: @milezjana.